Protein–RNA interactions for Protein: Q13610

PWP1, Periodic tryptophan protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PWP1Q13610 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PWP1Q13610 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms