Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NEUROD1Q13562 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NEUROD1Q13562 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
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