Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HSPB3Q12988 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HSPB3Q12988 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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