Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
AP1B1Q10567 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms