Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NIPAL4Q0D2K0 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms