Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNB2Q08289 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms