Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 POLR2E-204ENST00000586746 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CACNA1BQ00975 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNA1BQ00975 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNA1BQ00975 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNA1BQ00975 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNA1BQ00975 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNA1BQ00975 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNA1BQ00975 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNA1BQ00975 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNA1BQ00975 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNA1BQ00975 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNA1BQ00975 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNA1BQ00975 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNA1BQ00975 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CACNA1BQ00975 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1BQ00975 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1BQ00975 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1BQ00975 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1BQ00975 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1BQ00975 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1BQ00975 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1BQ00975 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1BQ00975 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1BQ00975 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1BQ00975 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1BQ00975 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1BQ00975 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1BQ00975 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CACNA1BQ00975 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms