Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDK3Q00526 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms