Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TFAMQ00059 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms