Protein–RNA interactions for Protein: P82094

TMF1, TATA element modulatory factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMF1P82094 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMF1P82094 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMF1P82094 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMF1P82094 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMF1P82094 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMF1P82094 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMF1P82094 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMF1P82094 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMF1P82094 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMF1P82094 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMF1P82094 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMF1P82094 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMF1P82094 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMF1P82094 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMF1P82094 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMF1P82094 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMF1P82094 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMF1P82094 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMF1P82094 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMF1P82094 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMF1P82094 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMF1P82094 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMF1P82094 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMF1P82094 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMF1P82094 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMF1P82094 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMF1P82094 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMF1P82094 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMF1P82094 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMF1P82094 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMF1P82094 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMF1P82094 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMF1P82094 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMF1P82094 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMF1P82094 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMF1P82094 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMF1P82094 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMF1P82094 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMF1P82094 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMF1P82094 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMF1P82094 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMF1P82094 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMF1P82094 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMF1P82094 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMF1P82094 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMF1P82094 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMF1P82094 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMF1P82094 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMF1P82094 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMF1P82094 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMF1P82094 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMF1P82094 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMF1P82094 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMF1P82094 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMF1P82094 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMF1P82094 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
TMF1P82094 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMF1P82094 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMF1P82094 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMF1P82094 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMF1P82094 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMF1P82094 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMF1P82094 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMF1P82094 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMF1P82094 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMF1P82094 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMF1P82094 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMF1P82094 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMF1P82094 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMF1P82094 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMF1P82094 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMF1P82094 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMF1P82094 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMF1P82094 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMF1P82094 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMF1P82094 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMF1P82094 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMF1P82094 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMF1P82094 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMF1P82094 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMF1P82094 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMF1P82094 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMF1P82094 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMF1P82094 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMF1P82094 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMF1P82094 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMF1P82094 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMF1P82094 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMF1P82094 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMF1P82094 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMF1P82094 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMF1P82094 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMF1P82094 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMF1P82094 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMF1P82094 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMF1P82094 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMF1P82094 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMF1P82094 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMF1P82094 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMF1P82094 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms