Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX2P50458 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX2P50458 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX2P50458 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX2P50458 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LHX2P50458 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LHX2P50458 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX2P50458 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX2P50458 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX2P50458 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX2P50458 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX2P50458 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX2P50458 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX2P50458 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX2P50458 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX2P50458 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX2P50458 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX2P50458 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX2P50458 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX2P50458 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX2P50458 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX2P50458 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX2P50458 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX2P50458 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX2P50458 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX2P50458 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX2P50458 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX2P50458 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX2P50458 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX2P50458 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX2P50458 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX2P50458 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX2P50458 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX2P50458 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX2P50458 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX2P50458 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LHX2P50458 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms