Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK8P49336 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK8P49336 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK8P49336 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK8P49336 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK8P49336 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK8P49336 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK8P49336 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDK8P49336 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK8P49336 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK8P49336 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK8P49336 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK8P49336 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK8P49336 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK8P49336 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK8P49336 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK8P49336 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK8P49336 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK8P49336 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK8P49336 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK8P49336 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK8P49336 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK8P49336 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK8P49336 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK8P49336 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK8P49336 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK8P49336 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK8P49336 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK8P49336 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK8P49336 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK8P49336 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK8P49336 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK8P49336 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK8P49336 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK8P49336 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK8P49336 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK8P49336 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK8P49336 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK8P49336 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK8P49336 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK8P49336 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDK8P49336 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK8P49336 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK8P49336 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK8P49336 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK8P49336 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK8P49336 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK8P49336 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK8P49336 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK8P49336 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK8P49336 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK8P49336 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK8P49336 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK8P49336 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK8P49336 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK8P49336 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK8P49336 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK8P49336 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK8P49336 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK8P49336 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK8P49336 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK8P49336 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK8P49336 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK8P49336 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDK8P49336 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK8P49336 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK8P49336 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK8P49336 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK8P49336 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK8P49336 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK8P49336 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK8P49336 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK8P49336 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK8P49336 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK8P49336 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK8P49336 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK8P49336 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK8P49336 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK8P49336 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK8P49336 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK8P49336 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK8P49336 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK8P49336 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK8P49336 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK8P49336 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK8P49336 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK8P49336 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK8P49336 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK8P49336 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK8P49336 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK8P49336 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK8P49336 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK8P49336 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK8P49336 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDK8P49336 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK8P49336 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK8P49336 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK8P49336 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK8P49336 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CDK8P49336 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms