Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TM4SF4P48230 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms