Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACTR1BP42025 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms