Protein–RNA interactions for Protein: P37275

ZEB1, Zinc finger E-box-binding homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZEB1P37275 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZEB1P37275 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms