Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARGP37231 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARGP37231 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARGP37231 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARGP37231 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARGP37231 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARGP37231 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARGP37231 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARGP37231 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARGP37231 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARGP37231 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARGP37231 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARGP37231 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARGP37231 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARGP37231 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARGP37231 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARGP37231 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARGP37231 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARGP37231 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARGP37231 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARGP37231 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARGP37231 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PPARGP37231 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARGP37231 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARGP37231 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARGP37231 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARGP37231 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARGP37231 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARGP37231 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARGP37231 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARGP37231 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARGP37231 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARGP37231 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARGP37231 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARGP37231 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARGP37231 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARGP37231 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARGP37231 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARGP37231 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARGP37231 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARGP37231 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARGP37231 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARGP37231 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARGP37231 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARGP37231 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARGP37231 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARGP37231 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARGP37231 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARGP37231 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARGP37231 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARGP37231 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARGP37231 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARGP37231 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARGP37231 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARGP37231 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARGP37231 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARGP37231 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARGP37231 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARGP37231 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARGP37231 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PPARGP37231 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARGP37231 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARGP37231 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARGP37231 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARGP37231 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARGP37231 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARGP37231 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARGP37231 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARGP37231 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARGP37231 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARGP37231 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARGP37231 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARGP37231 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARGP37231 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARGP37231 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARGP37231 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARGP37231 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARGP37231 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARGP37231 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARGP37231 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARGP37231 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARGP37231 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARGP37231 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARGP37231 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARGP37231 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARGP37231 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARGP37231 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARGP37231 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARGP37231 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARGP37231 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARGP37231 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARGP37231 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARGP37231 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARGP37231 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARGP37231 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARGP37231 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARGP37231 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARGP37231 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARGP37231 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PPARGP37231 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms