Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TRIM23P36406 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM23P36406 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms