Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HOXA9P31269 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms