Protein–RNA interactions for Protein: P23942

PRPH2, Peripherin-2, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPH2P23942 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PRPH2P23942 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRPH2P23942 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms