Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CALB2P22676 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CALB2P22676 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALB2P22676 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALB2P22676 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALB2P22676 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALB2P22676 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CALB2P22676 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALB2P22676 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALB2P22676 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALB2P22676 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALB2P22676 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALB2P22676 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALB2P22676 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALB2P22676 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALB2P22676 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALB2P22676 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALB2P22676 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALB2P22676 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CALB2P22676 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms