Protein–RNA interactions for Protein: P21359

NF1, Neurofibromin, humanhuman

Predictions only

Length 2,839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1P21359 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NF1P21359 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NF1P21359 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NF1P21359 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NF1P21359 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NF1P21359 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NF1P21359 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NF1P21359 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NF1P21359 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NF1P21359 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NF1P21359 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NF1P21359 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NF1P21359 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NF1P21359 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NF1P21359 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
NF1P21359 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
NF1P21359 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
NF1P21359 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
NF1P21359 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NF1P21359 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NF1P21359 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms