Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ATP4AP20648 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATP4AP20648 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms