Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNNI3P19429 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms