Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPB42P16452 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPB42P16452 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPB42P16452 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPB42P16452 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPB42P16452 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
EPB42P16452 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB42P16452 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB42P16452 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB42P16452 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB42P16452 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB42P16452 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB42P16452 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB42P16452 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB42P16452 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB42P16452 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB42P16452 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB42P16452 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB42P16452 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB42P16452 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB42P16452 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB42P16452 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB42P16452 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB42P16452 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB42P16452 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB42P16452 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB42P16452 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB42P16452 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB42P16452 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB42P16452 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB42P16452 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB42P16452 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB42P16452 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB42P16452 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB42P16452 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB42P16452 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB42P16452 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB42P16452 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB42P16452 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EPB42P16452 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EPB42P16452 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPB42P16452 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPB42P16452 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPB42P16452 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPB42P16452 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPB42P16452 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPB42P16452 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPB42P16452 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPB42P16452 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPB42P16452 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPB42P16452 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPB42P16452 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EPB42P16452 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms