Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
IFITM1P13164 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms