Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLK3P07288 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLK3P07288 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLK3P07288 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLK3P07288 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLK3P07288 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLK3P07288 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLK3P07288 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLK3P07288 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLK3P07288 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLK3P07288 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLK3P07288 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLK3P07288 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLK3P07288 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLK3P07288 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLK3P07288 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLK3P07288 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLK3P07288 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLK3P07288 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLK3P07288 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
KLK3P07288 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLK3P07288 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLK3P07288 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLK3P07288 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLK3P07288 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLK3P07288 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
KLK3P07288 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLK3P07288 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLK3P07288 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLK3P07288 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLK3P07288 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLK3P07288 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLK3P07288 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLK3P07288 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLK3P07288 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLK3P07288 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLK3P07288 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLK3P07288 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLK3P07288 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLK3P07288 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLK3P07288 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLK3P07288 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLK3P07288 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLK3P07288 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLK3P07288 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLK3P07288 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLK3P07288 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLK3P07288 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLK3P07288 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLK3P07288 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLK3P07288 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLK3P07288 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLK3P07288 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLK3P07288 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLK3P07288 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLK3P07288 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLK3P07288 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLK3P07288 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLK3P07288 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLK3P07288 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLK3P07288 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLK3P07288 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLK3P07288 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLK3P07288 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLK3P07288 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLK3P07288 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLK3P07288 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLK3P07288 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLK3P07288 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLK3P07288 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLK3P07288 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLK3P07288 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLK3P07288 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLK3P07288 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLK3P07288 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLK3P07288 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLK3P07288 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLK3P07288 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLK3P07288 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLK3P07288 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLK3P07288 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLK3P07288 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLK3P07288 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLK3P07288 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLK3P07288 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLK3P07288 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLK3P07288 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLK3P07288 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLK3P07288 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLK3P07288 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLK3P07288 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLK3P07288 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLK3P07288 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLK3P07288 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLK3P07288 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLK3P07288 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLK3P07288 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLK3P07288 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLK3P07288 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLK3P07288 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms