Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEFLP07196 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEFLP07196 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEFLP07196 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEFLP07196 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEFLP07196 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEFLP07196 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEFLP07196 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NEFLP07196 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NEFLP07196 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEFLP07196 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEFLP07196 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEFLP07196 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEFLP07196 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEFLP07196 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEFLP07196 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEFLP07196 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEFLP07196 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEFLP07196 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEFLP07196 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEFLP07196 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NEFLP07196 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFLP07196 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFLP07196 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFLP07196 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFLP07196 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFLP07196 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFLP07196 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFLP07196 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFLP07196 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFLP07196 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFLP07196 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFLP07196 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFLP07196 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFLP07196 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFLP07196 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFLP07196 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFLP07196 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFLP07196 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFLP07196 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFLP07196 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFLP07196 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFLP07196 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFLP07196 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFLP07196 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFLP07196 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFLP07196 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFLP07196 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFLP07196 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFLP07196 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFLP07196 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFLP07196 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFLP07196 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFLP07196 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFLP07196 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NEFLP07196 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFLP07196 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFLP07196 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFLP07196 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFLP07196 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFLP07196 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFLP07196 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFLP07196 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFLP07196 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFLP07196 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFLP07196 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFLP07196 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFLP07196 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFLP07196 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFLP07196 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFLP07196 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFLP07196 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFLP07196 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFLP07196 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFLP07196 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFLP07196 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFLP07196 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFLP07196 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFLP07196 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFLP07196 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFLP07196 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NEFLP07196 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEFLP07196 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEFLP07196 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEFLP07196 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEFLP07196 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEFLP07196 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEFLP07196 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEFLP07196 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEFLP07196 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEFLP07196 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NEFLP07196 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEFLP07196 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEFLP07196 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEFLP07196 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEFLP07196 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEFLP07196 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEFLP07196 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEFLP07196 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NEFLP07196 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms