Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGAVP06756 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms