Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PRB1P04280 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRB1P04280 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRB1P04280 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRB1P04280 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRB1P04280 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRB1P04280 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRB1P04280 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRB1P04280 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRB1P04280 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRB1P04280 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PRB1P04280 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PRB1P04280 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRB1P04280 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRB1P04280 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRB1P04280 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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PRB1P04280 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRB1P04280 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRB1P04280 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRB1P04280 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRB1P04280 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRB1P04280 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRB1P04280 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRB1P04280 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRB1P04280 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRB1P04280 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRB1P04280 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRB1P04280 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRB1P04280 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRB1P04280 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PRB1P04280 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRB1P04280 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRB1P04280 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRB1P04280 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRB1P04280 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRB1P04280 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRB1P04280 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRB1P04280 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRB1P04280 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRB1P04280 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRB1P04280 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRB1P04280 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRB1P04280 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRB1P04280 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRB1P04280 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRB1P04280 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRB1P04280 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PRB1P04280 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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