Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTNSO60931 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNSO60931 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNSO60931 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNSO60931 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNSO60931 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNSO60931 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNSO60931 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNSO60931 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNSO60931 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNSO60931 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNSO60931 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNSO60931 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNSO60931 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNSO60931 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNSO60931 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNSO60931 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNSO60931 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNSO60931 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNSO60931 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNSO60931 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNSO60931 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNSO60931 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNSO60931 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNSO60931 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNSO60931 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNSO60931 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNSO60931 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNSO60931 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNSO60931 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNSO60931 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNSO60931 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNSO60931 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNSO60931 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNSO60931 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CTNSO60931 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CTNSO60931 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms