Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PLIN1O60240 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms