Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB3O43889 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB3O43889 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB3O43889 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB3O43889 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB3O43889 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB3O43889 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB3O43889 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB3O43889 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB3O43889 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB3O43889 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB3O43889 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB3O43889 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB3O43889 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB3O43889 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CREB3O43889 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB3O43889 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB3O43889 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB3O43889 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB3O43889 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB3O43889 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB3O43889 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB3O43889 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB3O43889 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB3O43889 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB3O43889 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB3O43889 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB3O43889 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB3O43889 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB3O43889 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB3O43889 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB3O43889 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB3O43889 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB3O43889 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB3O43889 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB3O43889 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB3O43889 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB3O43889 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB3O43889 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB3O43889 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB3O43889 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB3O43889 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB3O43889 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB3O43889 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB3O43889 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB3O43889 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB3O43889 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB3O43889 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB3O43889 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB3O43889 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB3O43889 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB3O43889 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB3O43889 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB3O43889 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB3O43889 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB3O43889 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB3O43889 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB3O43889 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB3O43889 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CREB3O43889 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB3O43889 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB3O43889 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB3O43889 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB3O43889 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB3O43889 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB3O43889 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB3O43889 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB3O43889 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB3O43889 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB3O43889 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB3O43889 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB3O43889 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB3O43889 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB3O43889 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB3O43889 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB3O43889 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB3O43889 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB3O43889 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB3O43889 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB3O43889 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB3O43889 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB3O43889 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB3O43889 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB3O43889 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB3O43889 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB3O43889 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB3O43889 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB3O43889 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB3O43889 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB3O43889 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB3O43889 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB3O43889 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB3O43889 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB3O43889 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB3O43889 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB3O43889 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB3O43889 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB3O43889 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB3O43889 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CREB3O43889 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms