Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCAO15360 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCAO15360 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCAO15360 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCAO15360 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCAO15360 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCAO15360 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCAO15360 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCAO15360 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCAO15360 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCAO15360 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCAO15360 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCAO15360 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCAO15360 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCAO15360 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCAO15360 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCAO15360 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCAO15360 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCAO15360 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCAO15360 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCAO15360 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCAO15360 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCAO15360 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCAO15360 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCAO15360 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCAO15360 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCAO15360 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCAO15360 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCAO15360 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCAO15360 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCAO15360 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCAO15360 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCAO15360 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCAO15360 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCAO15360 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCAO15360 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCAO15360 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCAO15360 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCAO15360 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCAO15360 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCAO15360 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCAO15360 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCAO15360 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCAO15360 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCAO15360 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCAO15360 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCAO15360 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCAO15360 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCAO15360 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCAO15360 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCAO15360 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCAO15360 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCAO15360 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCAO15360 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCAO15360 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCAO15360 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCAO15360 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCAO15360 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCAO15360 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCAO15360 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCAO15360 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCAO15360 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCAO15360 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCAO15360 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCAO15360 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCAO15360 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCAO15360 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCAO15360 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCAO15360 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCAO15360 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCAO15360 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCAO15360 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCAO15360 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCAO15360 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCAO15360 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCAO15360 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCAO15360 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCAO15360 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCAO15360 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCAO15360 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCAO15360 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCAO15360 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCAO15360 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCAO15360 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCAO15360 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCAO15360 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FANCAO15360 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FANCAO15360 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FANCAO15360 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FANCAO15360 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FANCAO15360 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FANCAO15360 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FANCAO15360 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FANCAO15360 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FANCAO15360 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FANCAO15360 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FANCAO15360 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FANCAO15360 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FANCAO15360 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FANCAO15360 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms