Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TO15178 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TO15178 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms