Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EBAG9O00559 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms