Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ZNF879B4DU55 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms