Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC169A6NNP5 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms