Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9Y3F1 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms