Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UTP11Q9Y3A2 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms