Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX6

KIAA1024, UPF0258 protein KIAA1024, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1024Q9UPX6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
KIAA1024Q9UPX6 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KIAA1024Q9UPX6 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KIAA1024Q9UPX6 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
KIAA1024Q9UPX6 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
KIAA1024Q9UPX6 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms