Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ9

TNRC6B, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6BQ9UPQ9 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TNRC6BQ9UPQ9 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms