Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULS5

TMCC3, Transmembrane and coiled-coil domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCC3Q9ULS5 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TMCC3Q9ULS5 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms