Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TMPRSS11EQ9UL52 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms