Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SFMBT1Q9UHJ3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SFMBT1Q9UHJ3 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms