Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CGGBP1Q9UFW8 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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