Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
KLHL9Q9P2J3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.05■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KLHL9Q9P2J3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms