Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W0

IFNK, Interferon kappa, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNKQ9P0W0 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IFNKQ9P0W0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms