Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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MIS18AQ9NYP9 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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MIS18AQ9NYP9 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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MIS18AQ9NYP9 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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MIS18AQ9NYP9 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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MIS18AQ9NYP9 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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MIS18AQ9NYP9 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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MIS18AQ9NYP9 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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MIS18AQ9NYP9 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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MIS18AQ9NYP9 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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MIS18AQ9NYP9 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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MIS18AQ9NYP9 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MIS18AQ9NYP9 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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