Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BCL11BQ9C0K0 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BCL11BQ9C0K0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
BCL11BQ9C0K0 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BCL11BQ9C0K0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BCL11BQ9C0K0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCL11BQ9C0K0 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCL11BQ9C0K0 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCL11BQ9C0K0 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCL11BQ9C0K0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCL11BQ9C0K0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BCL11BQ9C0K0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms