Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRIM31Q9BZY9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms